14 Nisan 1965 yılında "Amerikalı Yeğenimiz" isimli bir temsile katılan aşırı güneyli bir casus olan John Wilkes Booth tarafından başından vuruldu ve ertesi gün öldü. Suikastçinin ilk planı Lincoln'ü kaçırıp Güneyli esirlerin salıverilmesi koşuluyla serbest bırakmaktı. Ancak sonradan planını suikaste çevirdi. Lincoln'ün temsili izlediği locanın giriş kapısına bir delik açan suikastçi, en komik sahnede kahkahaların yükseldiği anda silahını ateşledi. Başından vurulan Lincoln yere yığıldı.