H. pylori'nin hastalık yapıcı gücü, VacA adlı toksin, üreaz enzimi, peptidoglikan hücre duvarındaki proteinler ve diğer bazı faktörlerle ilişkilidir. Bu bakterinin hücrelerde yarattığı stres, sindirim sistemi bozuklukları, hücrelerin fenotipik değişimleri ve doku hasarlarına yol açar. Yapılan araştırmalar, hücrelerin H. pylori enfeksiyonunun neden olduğu bu hasarla mücadele ederken, mide kanserinin gelişiminde bu durumun temel etkenlerden biri olabileceğini düşündürmektedir.